Disease: Enfermedades mapeables a un código CIE-10

Una enfermedad se define como aquella “alteración o desviación del estado fisiológico en una o varias partes del cuerpo, por causas en general conocidas, manifestada por síntomas y signos característicos, y cuya evolución es más o menos previsible”.

Dentro de la categoría Disease se anotan las entidades que correspondan a enfermedades (ej: enfermedad de Alzheimer), trastornos (ej: trastorno de ansiedad) y síndromes (ej. síndrome de Guillain-Barré) que sean mapeables a un diagnóstico reconocido dentro de la terminología de clasificación estándar CIE-10 (Clasificación Internacional de Enfermedades).

El etiquetar enfermedades es un paso muy importante dentro de este trabajo pues nos permitirá, entre otras cosas, identificar comorbilidades en forma automática en una base de datos masiva. En caso de que tenga dudas de si una entidad corresponde o no a una enfermedad, puede en la plataforma BRAT usar la opción “click here to search” bajo “cie-10_norm_db”o si prefiere puede consultar https://eciemaps.mscbs.gob.es/ecieMaps/browser/index_10_mc.html.

Tenga en cuenta sin embargo, que dentro del CIE-10 también se encuentran algunos diagnósticos que no necesariamente corresponden a enfermedades (ej: embarazo), ademas de sígnos y síntomas, los cuales deben anotarse en otra categoría de entidades. En este sentido, se deberá poner a prueba si es que una entidad con código CIE-10 cualifica o no dentro de la categoría Disease, empleando para ello fuentes de conocimiento médico adicionales en caso de que sea necesario.

PACIENTE SUFRE ATROPELLO EN VIA PUBLICA RESULTANDO CON FRACTURA DIENTE 24 Y 26 AVULSION DIENTE 25 Traumatismo dento alveolar
T1	Disease 55 70	FRACTURA DIENTE
T3	Disease 79 94	AVULSION DIENTE
T5	Disease 98 124	Traumatismo dento alveolar
T2	Body_Part 88 97	DIENTE 25
T6	Clinical_Finding 15 24	ATROPELLO
T4	Body_Part 64 78	DIENTE 24 Y 26

Reglas positivas

• Anotar los atributos temporales sólo si el nombre específico de la enfermedad lo contiene.

… paciente presenta periodontitis crónica ...
T1 Disease 20 41 

Reglas negativas

• NO anotar los agentes causales como parte de la enfermedad.

Paciente con antecedentes de Osteomielitis por S. Aureus.
T1 Disease 29 56 

• NO incluir en las etiquetas la duración de las enfermedades, salvo cuando sea un atributo inherente del proceso patológico en sí.

… dx psiquiátricos de TAB de larga data…
T1 Disease 22 39 

• NO etiquetar como enfermedad las expresiones que describen identidad o atributo de un objeto.

Medidas generales Régimen diabético
T1 Clinical_Finding 26 35 

Caso especial

Los hallazgos clínicos o enfermedades mencionadas en los antecedentes familiares de los pacientes, que no estén asignados a un sujeto particular en la oración, deben ser etiquetados como hallazgo clínico con el atributo de “antecedente familiar”.

… sin antecedentes familiares de Enfermedad de Alzheimer.
T1 Disease 33 56 
A1 Implicit_Family_Background T1
A1 Negated T1

antecedentes familiares de trastorno por consumo de alcohol 
T1 Disease 27 59 
A1 Implicit_Family_Background T1

Niega antecedentes psiquiátricos familiares y personales 
T1 Clinical_Finding 6 32 
A1 Implicit_Family_Background T1
A1 Negated T1